四川大学是国家知识创新和科技创新的重要基地。拥有国家重点实验室和国家工程技术研究中心7个，国家技术转移中心1个，教育部重点实验室、工程研究中心及网上合作中心13个，卫生部重点实验室3个，省级重点实验室45个，“985工程”科技创新平台8个、哲学社会科学创新基地3个，全国高校哲学社会科学重点研究基地4个，国家级临床研究基地3个，医疗技术精湛的附属医院4所。学校在文学、史学、宗教学、数学、材料、能源、化工、轻纺、生物学、口腔医学、临床医学、基础医学等方面都有雄厚的科研实力，并取得了丰硕的研究成果。2006年，全校科研总经费达到7.5亿元，其中理工医科研经费超过7亿元，社科经费4587万元；学校是全国高校6家国家技术转移中心之一、全国10个知识产权保护试点大学之一，学校科技园是国家最早批准的15个国家大学科技园试点之一。