中国科学技术大学本科毕业生有两大去向：攻读硕士、博士学位和直接就业。自1982年以来，每年本科毕业生考取国内外研究生的比例约为70%，其中毕业当年出国留学比例约占本科毕业生总数的25%以上。直接参加就业的毕业生中，绝大部分进入国家重点科研院所和中外著名的高新技术产业，主要在北京、上海、江苏、浙江、广东等经济发达地区就业。
科大毕业生基础宽厚扎实，计算机和外语水平高，消化吸收先进科技知识和开拓科技新领域的能力强，发展潜力大，现代科技实验技能全面，深受用人单位青睐。可以说，科大是国内就业形势最好的几所大学之一。
2002-2009全校本科毕业生去向一览表
年度
2002
2003
2004
2005
2006
2007
2008
2009
毕业总人数
1398
1712
2531
1763
1797
1753
1866
1845
国内读研比例
52.3%
52.5%
42.4%
42.3%
37.6%
42.8%
40.2%
40%
出国读研比例
24.3%
24.9%
20.8%
17.8%
21.3%
24.5%
26.6%
28.4%
注：
1、考取国外研究生均为获得国外大学全额奖学金资助
2、国内研究生含免研人数
3、2004年因学制由五年改为四年，两届学生同时毕业